شبکه بهداشت و درمان باخرز پس از جدایی بخش باخرز از شهرستان تایباد و ارتقاء یافتن بخش باخرز به شهرستان در مهرماه 1389 و همزمان با سفر وزیر محترم بهداشت و درمان خانم دکتر دستجردی با جدا شدن مراکز بهداشتی درمانی بخش باخرز از تایباد افتتاح شد . این شبکه هم اکنون دارای 6 مرکز بهداشتی درمانی با ساختمان و تجهیزات و پرسنل می باشد شامل :

1 – مرکز بهداشتی درمانی شبانه روزی با تسهیلات زایمانی باخرز

2 – مرکز بهداشتی درمانی روستایی ارزنه

3 – مرکز بهداشتی درمانی روستایی قلعه نو علیا

4 – مرکز بهداشتی درمانی روستایی همت آباد

5 - مرکز بهداشتی درمانی روستایی پلبند و بهلول آباد

6 – مرکز بهداشتی درمانی روستایی استای

همچنین این شهرستان دارای 38 خانه بهداشت فعال می باشد .

با توجه به تازه تاسیس بودن ، این شبکه فاقد چارت سازمانی مصوب و ساختمان اداری شبکه و مرکز بهداشت می باشد که در حال حاضر با تعمیر و نقاشی ساختمان نیمه متروکه مرکز بهداشتی درمانی شماره 2 باخرز واقع در بخش 2 ، از این ساختمان به عنوان ستاد شبکه و مرکز بهداشت استفاده می شود . ساختمان بیمارستان 32 تختخوابی شهرستان در حال حاضر با 35% پیشرفت فیزیکی در دست ساخت می باشد .

همچنین تعداد 2 مرکز اورژانس 115 جاده ای و شهری هم اکنون در شهرستان فعال هستند .